Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ercc8Q8CFD5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ercc8Q8CFD5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ercc8Q8CFD5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ercc8Q8CFD5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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