Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms