Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms