Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CntrobQ8CB62 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms