Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Snx16Q8C080 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx16Q8C080 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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