Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjd4Q8BSD4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjd4Q8BSD4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms