Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGS3

Zkscan1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan1Q8BGS3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zkscan1Q8BGS3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zkscan1Q8BGS3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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