Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Liat1Q810M6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms