Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms