Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6aQ78XR0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms