Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nop58Q6DFW4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms