Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trim28Q62318 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim28Q62318 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim28Q62318 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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