Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall3Q62255 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms