Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms