Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms