Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Znf608Q56A10 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Znf608Q56A10 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Znf608Q56A10 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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Znf608Q56A10 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Znf608Q56A10 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Znf608Q56A10 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Znf608Q56A10 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Znf608Q56A10 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Znf608Q56A10 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf608Q56A10 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms