Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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D13Ertd608eQ3UPR8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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D13Ertd608eQ3UPR8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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D13Ertd608eQ3UPR8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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D13Ertd608eQ3UPR8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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