Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rnf180Q3U827 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rnf180Q3U827 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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