Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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