Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc10Q3TLI0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc10Q3TLI0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms