Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms