Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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