Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sox10Q04888 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sox10Q04888 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sox10Q04888 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sox10Q04888 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sox10Q04888 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sox10Q04888 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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