Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sox9Q04887 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms