Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg2Q03517 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms