Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms