Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms