Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 AC158238.1-201ENSMUST00000216899 1965 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rps28P62858 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Zfp677-201ENSMUST00000056107 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rps28P62858 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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