Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vsnl1P62761 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms