Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CgnP59242 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CgnP59242 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CgnP59242 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CgnP59242 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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