Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NcanP55066 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NcanP55066 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NcanP55066 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NcanP55066 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcanP55066 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcanP55066 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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