Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CitP49025 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CitP49025 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CitP49025 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CitP49025 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CitP49025 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CitP49025 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CitP49025 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CitP49025 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CitP49025 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CitP49025 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CitP49025 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CitP49025 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CitP49025 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CitP49025 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CitP49025 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms