Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rab11bP46638 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rab11bP46638 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rab11bP46638 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rab11bP46638 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rab11bP46638 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rab11bP46638 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rab11bP46638 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rab11bP46638 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rab11bP46638 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rab11bP46638 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rab11bP46638 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rab11bP46638 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab11bP46638 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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