Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprkP35822 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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