Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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