Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxraP28700 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxraP28700 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxraP28700 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxraP28700 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxraP28700 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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