Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Me1P06801 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Me1P06801 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Me1P06801 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms