Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cops6O88545 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cops6O88545 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cops6O88545 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cops6O88545 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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