Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ldb2O55203 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ldb2O55203 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ldb2O55203 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ldb2O55203 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ldb2O55203 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ldb2O55203 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ldb2O55203 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ldb2O55203 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ldb2O55203 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ldb2O55203 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ldb2O55203 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb2O55203 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ldb2O55203 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb2O55203 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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