Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptlc1O35704 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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