Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lhx8O35652 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lhx8O35652 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms