Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stag2O35638 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stag2O35638 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stag2O35638 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stag2O35638 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stag2O35638 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stag2O35638 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stag2O35638 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stag2O35638 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stag2O35638 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stag2O35638 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stag2O35638 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stag2O35638 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms