Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms