Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkcshO08795 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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