Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MttpO08601 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MttpO08601 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MttpO08601 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MttpO08601 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MttpO08601 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MttpO08601 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MttpO08601 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
MttpO08601 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MttpO08601 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MttpO08601 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MttpO08601 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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