Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms