Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ScaperF8VQ70 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms