Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 AC168276.1-201ENSMUST00000218963 2385 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm8314-201ENSMUST00000208964 1858 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dync1i2-207ENSMUST00000112142 2585 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Mamdc4-201ENSMUST00000095117 3990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Sh3rf1-202ENSMUST00000209611 4416 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 C820005J03Rik-201ENSMUST00000195997 2312 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Cxcl2-202ENSMUST00000200681 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Asph-208ENSMUST00000108334 2685 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Fam110c-201ENSMUST00000041133 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Gm20538F6Z9R1 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms