Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap58B2RW38 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap58B2RW38 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms