Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprbB2RU80 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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PtprbB2RU80 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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PtprbB2RU80 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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PtprbB2RU80 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PtprbB2RU80 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PtprbB2RU80 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprbB2RU80 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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